2021年3月14〜16日にオンラインで開催された第62回日本植物生理学会年会にて、永野、栗田、野村、前田が以下の発表を行いました。
「種子からデータへ：シロイヌナズナ幼植物のハイスループットトランスクリプトミクスのためのボトルネックの解消」
永野 惇, 野村 康之, 森山（毛利） 奈津美, 栗田 悠子, 鹿島 誠, 別役 重之
「自作小型培養庫を用いた植物季節応答の再現」
栗田 悠子, 滝本 裕則, 神谷 麻梨, 橋田 庸一, 鹿島 誠, 手塚 あゆみ, 七夕 高也, 永野 惇
「ハクサンハタザオとシロイヌナズナの年間遺伝子発現パターンの比較」
野村 康之, 永野 惇
「深層学習によるイネの野外トランスクリプトームモデルの構築と他種への転移学習」
前田 太郎, 大久保 智司, 鹿島 誠, 京極 大助, 橋田 庸一, 田中 克, 森 直哉, 渡邊 博之, 安達 俊輔, 永野 惇
2020年12月4～6日にオンラインで開催された第52回種生物学会シンポジウムにて、野村が以下のポスター発表を行いました。
「年変動を再現した人工気象器内におけるシロイヌナズナの遺伝子発現パターンと生産果実数」
野村康之, 永野惇
2020年9月19～21日にオンラインで開催された日本植物学会第84回大会にて、栗田が以下の発表を行いました。
「ポプラ短縮周年系を用い た季節的なリン転流機構 の解明と野外 RNA-Seq との比較」
栗田 悠子，馬場 啓一，手塚 あゆみ，出口 亜由美，大西 美輪，石崎 公庸，深城 英弘， 三村 徹郎，永野 惇
多検体のRNA-Seqを低コストに行うためのライブラリ作製手法の論文が公開されました。
実験用の詳細なプロトコルやその更新版は、以下のページで順次公開予定です。
ハクサンハタザオの野生集団をもちいて、全遺伝子の季節変動を２年間にわたって明らかにした論文が出版されました。
Nagano AJ, Kawagoe T, Sugisaka J, Honjo MN, Iwayama K, Kudoh H (2019) Annual transcriptome dynamics in natural environments reveals plant seasonal adaptation, Nature Plants, 5:74–83
2018年10月23〜26日に京都にて開催された6th Plant Dormancy Symposium 2018にて栗田が下記の発表を行い、ポスター賞をいただきました。
“Comparison of seasonal transcriptome of poplar trees (Populus alba. L) grown in field or a laboratory system.”
Yuko Kurita, Ayumi Tezuka, Ayumi Deguchi, Miwa Ohnishi, Kimitsune Ishizaki, Hidehiro Fukaki, Kei’ichi Baba, Tetsuro Mimura, Atsushi J. Nagano
日本の研究者の方々に加え、いつも論文を読ませていただいている海外の研究者の方々とも議論する機会をいただき、大変勉強になりました。
2018年10月18~19日に、CREST・さきがけの植物関係領域合同若手研究会に参加し、下記の発表を行いました。
ポスター番号 1 橋田 庸一
発表タイトル
SmartGC を用いた野外と制御環境におけるイネのトランスクリプトームの比較解析
ポスター番号 2 栗田 悠子
発表タイトル
自作小型培養庫SGCmini を用いた植物季節応答の再現
ポスター番号 3 鹿島 誠
発表タイトル
Expression-dynamics QTL に基づく 野外におけるイネの環境応答の予測
ポスター番号 4 神谷 麻梨
発表タイトル
RNA-Seq ライブラリ調製の低コスト・多検体化とシロイヌナズナにおけるAmbient な温
度応答の解析
ポスター番号 5 田中 克
発表タイトル
マツ材線虫病病原体が持つ分散型耐久性の生理学的・分子生物学的解析
以下の論文がアクセプトされました。
Kamitani, M., Nagano,A.J., Honjo,N.M., Kudoh,H. (Accepted)
“A Survey on Plant Viruses in Natural Brassicaceae Communities Using RNA-Seq”,
Microbial Ecology
第１９回日本動物遺伝育種学会にて手塚が以下の発表を行いました。
「対州馬保全に向けた島外対州馬の遺伝的状態の把握」
手塚あゆみ、高須正規、戸崎晃明、永野惇