気象データからトランスクリプトームを予測するパッケージ
FIT: Transcriptomic Dynamics Models in Field Conditions
が CRAN 上で公開されました。
こちらからダウンロードできるほか、R の”install.packages()”コマンドを使ってもインストールできます。
詳細はマニュアル等ドキュメントをご覧ください。
2016/9/12 追記
Windows 上でインストールする際は、以下のように”–no-multiarch”オプションを付けてください。
install.packages(“FIT”, INSTALL_opts = “–no-multiarch”)
第63回日本生態学会仙台大会にて、岩山、神谷、手塚がポスター発表します。
P2-104 野外における遺伝子発現量の予測 （岩山）
P2-136 RNA-Seq を用いたアブラナ科植物におけるウイルス・宿主相互作用の解測 (神谷)
P2-330 非モデル生物で利用可能な多検体ゲノムワイドＳＮＰ検出法（RAD-seq）の改良と要約作成ツールの提供（手塚）
1/21に行われる生態学会関東地区会国際シンポジウム “Ecological statistics”で、岩山が以下の発表を行います。
Prediction of transcriptome under fluctuating field conditions.
岩山幸治
11/6に統計数理研究所で行われた統計数理研究所共同研究集会「環境・生態データと統計解析 」で、岩山が以下の発表を行いました。
「野外サンプルの RNA-Seq データの予測」
岩山 幸治、本庄 三恵、岩崎 貴也、 永野 惇
第47回種生物学シンポジウムで、手塚が発表を行います。
「多検体かつ安価な改良版RAD-seq法の開発と サマリー作成方法の提供」
○手塚あゆみ、永野惇
RAD-seq解析に興味のある方は、ぜひお声をかけてください。
