論文

Genome sequence and analysis of the Japanese morning glory Ipomoea nil

anagano

基礎生物学研究所の星野敦さんらとの共同研究の論文が出版されました。

Hoshino A, Jayakumar V, Nitasaka E, Toyoda A, Noguchi H, Itoh T, Shin-I T, Minakuchi Y, Koda Y, Nagano AJ, Yasugi M, Honjo M, Kudoh H, Seki M, Kamiya A, Shiraki T, Carninci P, Asamizu E, Nishide H, Tanaka S, Park KI, Morita Y, Yokoyama K, Uchiyama I, Tanaka Y, Tabata S, Shinozaki K, Hayashizaki Y, Kohara Y, Suzuki Y, Sugano S, Fujiyama A, Iida S, Sakakibara Y (2016) Genome sequence and analysis of the Japanese morning glory Ipomoea nil., Nature Communications, 7, 13295

アサガオのゲノム解読の論文です。詳しくは、基礎生物学研究所のプレスリリースをご覧ください。

朝日新聞、読売新聞、中日新聞、東海愛知新聞（すべて2016年11月9日）などで報道されました。

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R パッケージ FIT: Transcriptomic Dynamics Models in Field Conditions

NaganoLab

気象データからトランスクリプトームを予測するパッケージ
FIT: Transcriptomic Dynamics Models in Field Conditions
が CRAN 上で公開されました。

こちらからダウンロードできるほか、R の”install.packages()”コマンドを使ってもインストールできます。
詳細はマニュアル等ドキュメントをご覧ください。

2016/9/12 追記
Windows 上でインストールする際は、以下のように”–no-multiarch”オプションを付けてください。

install.packages(“FIT”, INSTALL_opts = “–no-multiarch”)

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Northern glacial refugia and altitudinal niche divergence shape genome-wide differentiation in the emerging plant model Arabidopsis arenosa

anagano

Charles UniversityのKarol Marholdさんらとの共同研究の論文が出版されました。

Kolar F, Fuxova G, Zaveska E, Nagano AJ, Hyklova L, Lucanova M, Kudoh H, Marhold K (2016) Northern glacial refugia and altitudinal niche divergence shape genome-wide differentiation in the emerging plant model Arabidopsis arenosa., Molecular Ecology, in press.

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Genome wide Molecular Polymorphisms among Maize (Zea mays L.) Inbred Lines Found from Restriction-Associated DNA Tag Sequencing (RAD-Seq) Analysis as a Preliminary Study on “Genomewide Selection” for Breeding by Japanese Public Sectors

anagano

畜産草地研究所の玉置さんらとの共同研究の論文が出版されました。

Tamaki H, Mitsuhashi S, Kudoh H, Nagano AJ and Yasugi M (2016) Genome wide Molecular Polymorphisms among Maize (Zea mays L.) Inbred Lines Found from Restriction-Associated DNA Tag Sequencing (RAD-Seq) Analysis as a Preliminary Study on “Genomewide Selection” for Breeding by Japanese Public Sectors., Bulletin of NARO Institute of Livestock and Grassland Science, 16: 1-9.

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Truncated yet functional viral protein produced via RNA polymerase slippage implies underestimated coding capacity of RNA viruses

anagano

北海道大学の薦田さんらとの共同研究の論文が出版されました。

Hagiwara-Komoda Y, Choi SH, Sato M, Atsumi G, Abe J, Fukuda J, Honjo MN, Nagano AJ, Komoda K, Nakahara KS, Uyeda I, Naito S (2016) Truncated yet functional viral protein produced via RNA polymerase slippage implies underestimated coding capacity of RNA viruses., Scientific Reports, in press.

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Detection of diurnal variation of tomato transcriptome through the molecular timetable method in a sunlight-type plant factory

anagano

大阪府立大学の東さん、福田さんらとの共同研究の論文が出版されました。

Higashi T,  Tanigaki Y, Takayama K, Nagano AJ,  Honjo MN and  Fukuda H (2016) Detection of diurnal variation of tomato transcriptome through the molecular timetable method in a sunlight-type plant factory., Frontiers in Plant Science, in press.

 

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