第80回日本植物学会年会

9/16~29に沖縄で開催された第80回日本植物学会年会のシンポジウム「植物-微生物の見えない相互作用を観る:現在と未来」にて神谷が発表を行いました。

2aSA02 野生植物内のウイルス・宿主間、 ウイルス種間相互作用を RNA-Seq で観る,  神谷麻梨, 永野惇, 本庄三恵, 工藤洋

また、同シンポジウムで、永野がオーガナイザを務めました。

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R パッケージ FIT: Transcriptomic Dynamics Models in Field Conditions

気象データからトランスクリプトームを予測するパッケージ
FIT: Transcriptomic Dynamics Models in Field Conditions
が CRAN 上で公開されました。

こちらからダウンロードできるほか、R の”install.packages()”コマンドを使ってもインストールできます。
詳細はマニュアル等ドキュメントをご覧ください。

2016/9/12 追記
Windows 上でインストールする際は、以下のように”–no-multiarch”オプションを付けてください。

install.packages(“FIT”, INSTALL_opts = “–no-multiarch”)

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Northern glacial refugia and altitudinal niche divergence shape genome-wide differentiation in the emerging plant model Arabidopsis arenosa

Charles UniversityのKarol Marholdさんらとの共同研究の論文が出版されました。

Kolar F, Fuxova G, Zaveska E, Nagano AJ, Hyklova L, Lucanova M, Kudoh H, Marhold K (2016) Northern glacial refugia and altitudinal niche divergence shape genome-wide differentiation in the emerging plant model Arabidopsis arenosa., Molecular Ecology, in press.

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第57回日本植物生理学会年会

3/18~20に盛岡で開催された第57回日本植物生理学会年会にて神谷、永野が発表を行いました。

2aH03 野生植物のRNA-Seqによるウイルス・ホスト相互作用の解明、○神谷麻梨,永野惇,本庄三恵,工藤洋

S05-7 Novel challenges raised by field transcriptomics, Atsushi J. Nagano

また、シンポジウムS05 Challenge to the outdoor environment by the experimental plant physiologyにおいて、永野がオーガナイザを務めました。

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